首先，股權轉讓糾紛屬於合同糾紛一種，由被告住所地或者合同履行地的人民法院管轄版。根據2013版民事訴訟法第二權十三條的規定，因合同糾紛提起的訴訟，由被告住所地或者合同履行地人民法院管轄。最高院在最新的民訴法司法解釋明確，合同約定履行地點的，以約定的履行地點為合同履行地。合同對履行地點沒有約定或者約定不明確，爭議標的為給付貨幣的，接收貨幣一方所在地為合同履行地；交付不動產的，不動產所在地為合同履行地；其他標的，履行義務一方所在地為合同履行地。即時結清的合同，交易行為地為合同履行地。合同沒有實際履行，當事人雙方住所地都不在合同約定的履行地的，由被告住所地人民法院管轄。
其次，其他與公司有關的糾紛，由公司住所地人民法院管轄。根據2013版民事訴訟法二十六條規定，因公司設立、確認股東資格、分配利潤、解散等糾紛提起的訴訟，由公司住所地人民法院管轄。 最高院在最新的民訴法司法解釋明確，因股東名冊記載、請求變更公司登記、股東知情權、公司決議、公司合並、公司分立、公司減資、公司增資等糾紛提起的訴訟，依照民事訴訟法第二十六條規定確定管轄。
② 2013新民事訴訟法後股權轉讓糾紛 法院管轄
首先，股權轉讓糾抄紛屬於合同糾紛一種，由被告住所地或者合同履行地的人民法院管轄。根據2013版民事訴訟法第二十三條的規定，因合同糾紛提起的訴訟，由被告住所地或者合同履行地人民法院管轄。最高院在最新的民訴法司法解釋明確，合同約定履行地點的，以約定的履行地點為合同履行地。合同對履行地點沒有約定或者約定不明確，爭議標的為給付貨幣的，接收貨幣一方所在地為合同履行地；交付不動產的，不動產所在地為合同履行地；其他標的，履行義務一方所在地為合同履行地。即時結清的合同，交易行為地為合同履行地。合同沒有實際履行，當事人雙方住所地都不在合同約定的履行地的，由被告住所地人民法院管轄。
其次，其他與公司有關的糾紛，由公司住所地人民法院管轄。根據2013版民事訴訟法二十六條規定，因公司設立、確認股東資格、分配利潤、解散等糾紛提起的訴訟，由公司住所地人民法院管轄。 最高院在最新的民訴法司法解釋明確，因股東名冊記載、請求變更公司登記、股東知情權、公司決議、公司合並、公司分立、公司減資、公司增資等糾紛提起的訴訟，依照民事訴訟法第二十六條規定確定管轄。
③ 如何確定股權轉讓合同糾紛案件的管轄
證明當事人訴訟主來體資格的自證據（1）當事人為公民的，應提交身份證或戶口本；（2）當事人為法人或其他組織的，應提交登記資料，如《工商營業執照》副本、工商登記機關出具的公司注冊登記資料、社團法人登記證等;（3）當事人名稱在法律關系成立後有變更的，應提交登記機關出具的變更證明。證明股權轉讓合同成立的證據（1）股東同意轉讓（出資）的證據；（2）當事人簽訂的《股權轉讓合同》及補充協議和《公司章程》。證明股權轉讓合同履行情況的證據（1）資產評估報告、驗資報告等；（2）出讓或接收股權（出資）的證明。如給付、接收轉讓股款，公司出具的出資證明書、股東名冊，出讓方將公司的管理權轉移給受讓方的證據等；（3）工商登記機關股權變更登記的資料。提交訴訟請求的計算依據（1）支持訴訟請求的有關計算方法及計算清單。如本金、利息、違約金、賠償金的計算清單；（2）當事人認為應當向法庭提交的其他證據。以上是關於股權轉讓協議糾紛案件應提供證據的總結，若能提供進一步的信息，有助於提供更詳細准確的解答。