1. 分公司在其他地方已经受到行政处罚，总公司在当地工商部门还要受到行政处罚
1、《国家工商行政管理总局关于认定违法主体有关问题的答复》中陈述道：各类企业法人设立的不能独立承担责任的分支机构，均属于从事经营活动的经济组织（企业和经营单位），依照《行政处罚法》等现行有关规定，该经济组织可以作为行政处罚案件的当事人；当该经济组织不能完全承担有关行政责任时，应由其所隶属的企业法人承担。
2、根据上述规定，分公司可以作为行政处罚的当事人。
3、分公司因违法行为被查处后，工商部门不得再以“同一违法”对总公司进行处罚。否则，工商部门的行为就违反了“一事不再罚”的原则，属于违法。但是，由于分公司不能完全履行行政处罚责任的时候（比如交不起罚款等……），总公司还是要为分公司承担的。
4、建议你们把分公司已经接受处罚的《行政处罚决定书》，复印一份给拟对总公司予以处罚的工商部门，向其提出异议。
5、详细情况难以用一二句话说清楚，要根据你们公司具体的行为，以及工商部门已经做出的《行政处罚决定书》中所列举的法律依据而定。