1. 增值税专用发票丢失（丢失前未认证，且已超过抵扣期限）
已经超过抵扣期限，肯定是不能再抵扣了，全额记如原材料成本。你可以按照增值税专用发票管理办法，去销货方办理已报税证明单、复印发票存根联作为记账凭证附件，但不能认证抵扣进项税额，仅仅只能作为企业所得税税前扣除依据，否则，不能进行所得税税前扣除。
2. 增值税专用发票超过认证期限未认证该怎么处理
增值税专用发票超过认证期（180天）未认证，不能再认证抵扣进项税额，也不能开具红字发票，可以将价税合计一起计入成本费用。
3. 增值税专用发票超过认证期限怎么办
国家税务总局公告2011年第50号关于逾期增值税扣税凭证抵扣问题的公告 为保障纳税人合法权益，经国务院批准，现将2007年1月1日以后开具的增值税扣税凭证未能按照规定期限办理认证或者稽核比对（以下简称逾期）抵扣问题公告如下：
一、对增值税一般纳税人发生真实交易但由于客观原因造成增值税扣税凭证逾期的，经主管税务机关审核、逐级上报，由国家税务总局认证、稽核比对后，对比对相符的增值税扣税凭证，允许纳税人继续抵扣其进项税额。
增值税一般纳税人由于除本公告第二条规定以外的其他原因造成增值税扣税凭证逾期的，仍应按照增值税扣税凭证抵扣期限有关规定执行。
本公告所称增值税扣税凭证，包括增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书和公路内河货物运输业统一发票。
二、客观原因包括如下类型：
（一）因自然灾害、社会突发事件等不可抗力因素造成增值税扣税凭证逾期；
（二）增值税扣税凭证被盗、抢，或者因邮寄丢失、误递导致逾期；
（三）有关司法、行政机关在办理业务或者检查中，扣押增值税扣税凭证，纳税人不能正常履行申报义务，或者税务机关信息系统、网络故障，未能及时处理纳税人网上认证数据等导致增值税扣税凭证逾期；
（四）买卖双方因经济纠纷，未能及时传递增值税扣税凭证，或者纳税人变更纳税地点，注销旧户和重新办理税务登记的时间过长，导致增值税扣税凭证逾期；
（五）由于企业办税人员伤亡、突发危重疾病或者擅自离职，未能办理交接手续，导致增值税扣税凭证逾期；
（六）国家税务总局规定的其他情形。
三、增值税一般纳税人因客观原因造成增值税扣税凭证逾期的，可按照本公告附件《逾期增值税扣税凭证抵扣管理办法》的规定，申请办理逾期抵扣手续。
四、本公告自2011年10月1日起执行。
特此公告。
4. 增值税发票抵扣联丢失并过了认证期限，怎么解决
纳税人增值税专票未认证发生丢失，且超过认证期限，应先取得记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《证明单》，然后按照《逾期增值税扣税凭证抵扣管理办法》的规定申请办理逾期抵扣手续）。
《国家税务总局关于简化增值税发票领用和使用程序有关问题的公告》（国家税务总局公告2014年第19号
）规定：
“三、简化丢失专用发票的处理流程一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，如果丢失前已认证相符的，购买方可凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》或《丢失货物运输业增值税专用发票已报税证明单》（附件1、2，以下统称《证明单》），作为增值税进项税额的抵扣凭证；如果丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件进行认证，认证相符的可凭专用发票记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《证明单》，作为增值税进项税额的抵扣凭证。专用发票记账联复印件和《证明单》留存备查。”
《国家税务总局关于逾期增值税扣税凭证抵扣问题的公告》（国家税务总局公告2011年第50号）规定：
“一、对增值税一般纳税人发生真实交易但由于客观原因造成增值税扣税凭证逾期的，经主管税务机关审核、逐级上报，由国家税务总局认证、稽核比对后，对比对相符的增值税扣税凭证，允许纳税人继续抵扣其进项税额。
增值税一般纳税人由于除本公告第二条规定以外的其他原因造成增值税扣税凭证逾期的，仍应按照增值税扣税凭证抵扣期限有关规定执行。
二、客观原因包括如下类型：
（一）因自然灾害、社会突发事件等不可抗力因素造成增值税扣税凭证逾期；
（二）增值税扣税凭证被盗、抢，或者因邮寄丢失、误递导致逾期；
（三）有关司法、行政机关在办理业务或者检查中，扣押增值税扣税凭证，纳税人不能正常履行申报义务，或者税务机关信息系统、网络故障，未能及时处理纳税人网上认证数据等导致增值税扣税凭证逾期；
（四）买卖双方因经济纠纷，未能及时传递增值税扣税凭证，或者纳税人变更纳税地点，注销旧户和重新办理税务登记的时间过长，导致增值税扣税凭证逾期；
（五）由于企业办税人员伤亡、突发危重疾病或者擅自离职，未能办理交接手续，导致增值税扣税凭证逾期；
（六）国家税务总局规定的其他情形。”
根据以上文件规定，如果纳税人增值税专票未认证发生丢失，且超过认证期限，应先取得记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《证明单》，然后按照《逾期增值税扣税凭证抵扣管理办法》的规定申请办理逾期抵扣手续）。
5. 增值税发票抵扣联丢失并过了认证期限怎么解决
用发票联价税合计计入购入商品或材料的成本，还要给国税局写个具体的某某发票不能如期验证及抵扣的说明，因为不告知税务的话，时间长了，他们是会知道并过问的。
6. 增值税专用发票认证抵扣期限过了怎么办
增值税专用发票超过了自开票日期180天的，就不能再抵扣进项税款了，属于内滞留票，滞留票要写出详容细的滞留原因，无正当理由不抵扣进项税的要补交滞留票中所含的税金及滞纳金，情节严重的有可能还要停止使用增值税专用发票，交回金税盘。
7. 增值税发票丢失且已超过180的认证期限,如何补救
很遗憾地告诉你没办法补救了。增值税专用发票的认证期限为180天，丢失增值税专用发票的本来可以凭销方主管国税机关出具的已报税证明单和记帐联复印件认证抵扣，由于你现在已超过180天所以是不能再认证了。而未认证的发票想要退回开红字发票冲了重新开票的话也必须在180天内办理，所以你说的情况确实没办法补救了，只有凭销方主管国税机关出具的已报税证明单和记帐联复印件作帐务处理，进项税全部计入成本了。
8. 购货方把增值税专用发票丢失了，已超过认证期限，应怎么处理
这个有点麻烦也 那应该当月就给你们讲 你们当月就可以作废
跨月了 还超期 你只有去找你单位的税务专管员 看能不能打份红票来冲销
要打红票申请表 专管员要批 才能开红票来冲
我们这面是这样 不晓得你们那面是不是一样
仅供参考
9. 增值税专用发票遗失超过认证期限的购买方怎么入账
一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，如果丢失前已认证相符的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》（附件5），经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证；如果丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件到主管税务机关进行认证，认证相符的凭该专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证。
由于在寄出的途中丢失了，应当属于丢失前未认证增值税专用发票，因此，购买方（客户）凭销售方（贵公司）提供的相应专用发票记账联复印件到主管税务机关进行认证，认证相符的凭该专用发票记账联复印件及销售方（贵公司)所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方(客户）主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证。
10. 增值税专用发票超过认证期限未抵扣如何处理
根据国家税务总局公告［2011］第050号《关于逾期增值税扣税凭证抵扣问题的公告》的规定：对增值税一般纳税人发生真实交易但由于客观原因造成增值税扣税凭证逾期的，经主管税务机关审核、逐级上报，由国家税务总局认证、稽核比对后，对比对相符的增值税扣税凭证，允许纳税人继续抵扣其进项税额。增值税一般纳税人由于除本公告第二条规定以外的其他原因造成增值税扣税凭证逾期的，仍应按照增值税扣税凭证抵扣期限有关规定执行。
客观原因包括如下类型：（一）因自然灾害、社会突发事件等不可抗力因素造成增值税扣税凭证逾期；（二）增值税扣税凭证被盗、抢，或者因邮寄丢失、误递导致逾期；（三）有关司法、行政机关在办理业务或者检查中，扣押增值税扣税凭证，纳税人不能正常履行申报义务，或者税务机关信息系统、网络故障，未能及时处理纳税人网上认证数据等导致增值税扣税凭证逾期；（四）买卖双方因经济纠纷，未能及时传递增值税扣税凭证，或者纳税人变更纳税地点，注销旧户和重新办理税务登记的时间过长，导致增值税扣税凭证逾期；（五）由于企业办税人员伤亡、突发危重疾病或者擅自离职，未能办理交接手续，导致增值税扣税凭证逾期；（六）国家税务总局规定的其他情形。
因此，若你公司逾期未认证抵扣的原因属于公告所述的客观原因，可向其主管税务机关申请抵扣进项税额。但如果你公司是由于疏忽导致发票逾期未认证，不属于公告所述的客观原因，则此发票不得抵扣，只能由公司承担此损失，公司有权向直接责任人追偿。