1. 股權轉讓後,公司拒不辦理工商變更登記怎麼辦
股權轉讓意味著公司股東的變更，而股東的變更是公司工商變更登記規定的項目之一。
《公司登記管理條例》第35條)如果股權轉讓後不依法辦理變更登記手續將不能對抗善意第三人。股東權利將得不到法律保護。
股權轉讓必須得有公司全體股東同意後才能辦轉讓，不同意轉讓的，股東有優先認購股權的權利，
你們轉讓股權是否有召開股東會決議，股東會同意這部分轉讓。你的情況最好咨詢律師。
2. 股權轉讓合同中「不辦理工商變更登記」的約定是否有效
這么個約定是無效的，必須要辦理變更登記。至於如果簽署了，合同是否有效要分成兩個層面，對於轉讓雙方來說，合同還是有效的，但是對於不知情第三人來說，這個合同是不具有對抗效力的，簡單點說就是如果第三人這時候也出錢買了這個股權然後去變更了，無論誰的合同先訂立，他的權利都優先於你。
參考：《公司法》第33條規定，有限責任公司應當置備股東名冊，記載下列事項：
股東的姓名或者名稱及住所；
股東的出資額；
出資證明書編號。
記載於股東名冊的股東，可以依股東名冊主張行使股東權利。
公司應當將股東的姓名或者名稱及其出資額向公司登記機關登記；登記事項發生變更的，應當辦理變更登記。未經登記或者變更登記的，不得對抗第三人。
《公司登記管理條例》（2005年修訂）第三十二條規定，公司變更實收資本的，應當提交依法設立的驗資機構出具的驗資證明，並應當按照公司章程載明的出資時間、出資方式繳納出資。公司應當自足額繳納出資或者股款之日起30日內申請變更登記。
可見，在有限責任公司，受讓人即使簽訂了股權轉讓合同，且合同已經生效，在公司為其履行股東名冊登記變更程序之前，尚不能認定其已取得了股東資格，只有在公司股東名冊變更並進行工商變更登記之後，新老股東的交替方才在法律上真正完成，並具有了社會公示性。股份有限公司股權轉讓的情況有所不同。其股權轉讓合同生效，受讓人即取得公司股權，合同當事人為記名股東的，應通知公司辦理股東名冊登記變更。
需要說明的是，上述登記變更手續具有宣示性或對抗性，是受讓人保護自身權利，對抗公司或第三人最有效的手段，實踐中一定要予以高度重視，千萬不能因為一時的手續繁瑣而不為從而留下隱患。
3. 股權轉讓未辦工商登記有效嗎
私自轉讓股權未經工商核准登記，其轉讓行為不受法律保護。
依據《中華人民內共和國容公司登記管理條例》第三十四條的股東，公司變更股東的，應當自變更之日起30日內向工商登記機關申請變更登記，並提交新股東的主體資格證明或者自然人身份證明。
股東向股東轉讓股權，或向股東以外的人轉讓股權的，應當向原公司登記機關申請變更登記，對受讓方、轉讓方而言都具有保護意義。
4. 哪些股權轉讓不用辦理工商變更登記
1、有限責任公司內部股東之間不引起股東名稱發生變化的股權轉讓，無需辦理工商變更登記。
根據2014年新修訂的《中華人民共和國公司登記管理條例》（以下稱「公登條例」）第九條規定，「登記事項」僅包括「有限責任公司股東的名稱或姓名」，而不包括股東認繳和實繳的出資額。
因此，如果僅僅是公司股東內部之間的股權轉讓，且該等轉讓並未引起股東名稱發生變化，則該等股權轉讓無須辦理工商變更登記。
例如：騰訊眾創空間股東甲、乙各持股50%，股東甲將其中的30%轉讓給乙，甲持股20%，乙持股80%。
騰訊眾創空間股東在股權轉讓前後均為甲、乙，此次轉讓未導致騰訊眾創空間股東名稱發生變化，因此無需辦理工商變更登記手續。
從工商登記角度而言，新的公登條例實施後，僅「有限責任公司股東的名稱或姓名」系登記事項，只要「股東名稱」沒有發生變化，就無需辦理變更登記手續。
但如果「股東名稱」變化了，包括股東更換和股東更名，則均需辦理相應工商變更登記手續。
2、所有的非上市股份有限公司股權轉讓，均無需辦理工商變更登記。
你沒有看錯，所有的非上市股份有限公司股權轉讓，均無需辦理工商變更登記。
這會出乎很多人的「意料」，甚至很多專業人士都會表示不解。
但目前的操作實踐是，非上市股份有限公司的股權轉讓，無需辦理工商變更登記手續。
可能還有人會將信將疑：「所有的非上市股份有限公司的股權轉讓，都無需辦理工商變更登記手續嗎？」我們肯定的告訴你：是！相較於有限責任公司股權轉讓僅限於「股東內部不引起股東名冊發生變化的股權轉讓」，無需辦理工商變更登記的非上市股份有限公司的股權轉讓則是「所有的」。
立刻會有人質問：不對啊！公登條例不是說「股份有限公司發起人」是登記事項嗎？我們要提醒你：公司登記條例說的是「發起人的姓名或者名稱」，而不是「發起人」。
兩者有什麼區別，下面會詳細講解。
根據公登條例相關條文的規定，非上市股份有限公司股權轉讓依法不屬於《中華人民共和國公司登記管理條例》第九條登記事項的范圍，所以非上市股份有限公司股權轉讓不需申請工商變更登記。
而且可以肯定的告訴你，至少目前在上海，工商部門並不受理非上市股份有限公司股權轉讓變更登記業務。